博士學術沙龍

2019年博士學術沙龍第二十一期

[发布日期:2019-11-04 点击数: ]

活動時間:11月6日(周三)19:00

活動地點:生物樓313

主講人及主要內容:

(一)報告題目:基于隨機微分方程的功能作圖模型構建及應用

報告人:甘静雯 计算生物学与生物信息学博士研究生

報告內容:根據胡楊F1代雜交群體表型數據,利用所發展的統計模型和計算平台進行分析。根據獲取的表型數據選擇最佳的隨機微分方程進行擬合,根據隨機微分方程選擇最佳的參數優化方法。然後在功能作圖的框架中構建似然函數結合EM算法和卡爾曼濾波的程序獲得參數的最大似然估計。臨界值使用排列檢測方法獲得,最終確定影響胡楊生長發育相關的QTLs位點。並利用生物信息學的方法挖掘與此性狀相關的候選基因,預測相關基因功能,目的是爲後續功能驗證提供指導。

(二)報告題目:構建原始卵泡發育的基因調控網絡

報告人:王茜 计算生物学与生物信息学博士研究生

報告內容:原始卵泡發育決定女性生殖力儲備,發育異常會導致卵巢早衰和不孕症。原始卵泡的發育有多因素參與,受複雜的基因網絡調控,構建它的網絡模型有助于闡明原始卵泡的發育機制,提高卵泡異常疾病的診治水平。針對原始卵泡發育的特點,結合常微分方程,利用單細胞測序的轉錄組信息,構建它的基因調控網絡模型。解析該模型,不僅可以獲得各基因間互作的模式和效應;還可以獲得影響原始卵泡發育的關鍵基因以及網絡間互作對發育的影響。

(三)報告題目:Biopolymer-coated nanoliposomes as carriers of rainbow trout skin-derived antioxidant peptides

報告人:冯艳霞 计算生物学与生物信息学博士研究生

報告內容:在這項研究中,從虹鳟魚(Oncorhynchus mykiss)皮膚明膠水解産物中分離出的分子量<30kDa(PF30)的抗氧化劑肽組分被封裝在殼聚糖包被的納米脂質體中。含有PF30的脂質體納米囊的平均粒徑在163.4-234 nm 範圍內,且多分散指數較低(PDI < 0.5)。此外,ζ電勢從未包衣脂質體中的+3.9mV變爲在生物聚合物包衣脂質體中的+45.5mV。FTIR光譜顯示磷脂頭部和殼聚糖的氨基之間通過靜電相互作用以及氫鍵相連接。PF30的包封率在以0.4%(w/v)的殼聚糖包被的納米脂質體中最高。生物聚合物塗層脂質體在體外顯示出更持久的肽釋放行爲。此外,殼聚糖包衣的納米脂質體保持了PF30的抗氧化活性,可以被認爲是在營養食品和功能食品中有效遞送生物活性化合物的潛在候選者。